Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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CCDC6Q16204 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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