Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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