Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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