Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
BRD3Q15059 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms