Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQLEQ14534 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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