Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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CDH18Q13634 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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CDH18Q13634 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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CDH18Q13634 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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CDH18Q13634 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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CDH18Q13634 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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CDH18Q13634 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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