Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TOP3AQ13472 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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