Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RESTQ13127 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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RESTQ13127 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RESTQ13127 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RESTQ13127 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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RESTQ13127 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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RESTQ13127 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RESTQ13127 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RESTQ13127 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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