Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
KCNH2Q12809 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms