Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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GTF3C1Q12789 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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GTF3C1Q12789 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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GTF3C1Q12789 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GTF3C1Q12789 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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GTF3C1Q12789 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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GTF3C1Q12789 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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GTF3C1Q12789 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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GTF3C1Q12789 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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GTF3C1Q12789 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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GTF3C1Q12789 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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GTF3C1Q12789 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
GTF3C1Q12789 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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