Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ALDH1L1-210ENST00000472186 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PXYLP1-207ENST00000508812 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC02280-201ENST00000564585 3816 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CACNB2-204ENST00000377315 3461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 WDR47-205ENST00000400794 4134 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 FHAD1-206ENST00000375998 4355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RASSF6-201ENST00000307439 5994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TTPAL-202ENST00000372904 6234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 S100A7A-203ENST00000368729 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNNA2-203ENST00000402739 3684 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZSCAN26-202ENST00000421553 2835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SEZ6-204ENST00000442608 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 C5orf66-205ENST00000555438 3246 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 IL17RD-202ENST00000320057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNF38-206ENST00000377885 4985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 GUCY1B3-201ENST00000264424 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDH11-202ENST00000394156 6874 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 OPCML-207ENST00000541867 6277 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 OPCML-208ENST00000612177 6250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 SETD7-207ENST00000608958 5281 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-11Q9BYQ6 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms