Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CA9Q16790 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CA9Q16790 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CA9Q16790 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CA9Q16790 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CA9Q16790 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CA9Q16790 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CA9Q16790 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms