Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ECM1Q16610 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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