Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SS18Q15532 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
SS18Q15532 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
SS18Q15532 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms