Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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