Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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PKP1Q13835 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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PKP1Q13835 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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PKP1Q13835 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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PKP1Q13835 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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