Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TUBA3CQ13748 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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