Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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