Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRDM2Q13029 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms