Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB40BQ12829 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms