Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms