Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VGFO15240 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VGFO15240 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VGFO15240 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VGFO15240 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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