Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
UBR3Q6ZT12 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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UBR3Q6ZT12 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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UBR3Q6ZT12 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBR3Q6ZT12 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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