Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TPRNQ4KMQ1 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TPRNQ4KMQ1 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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