Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SGCAQ16586 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
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SGCAQ16586 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SGCAQ16586 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SGCAQ16586 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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