Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC85BQ15834 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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