Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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