Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAPTM4AQ15012 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms