Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SSPNQ14714 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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