Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IKZF1Q13422 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IKZF1Q13422 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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