Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CALCOCO2Q13137 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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