Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNB1Q02641 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CACNB1Q02641 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms