Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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