Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRGP23470 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRGP23470 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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PTPRGP23470 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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PTPRGP23470 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRGP23470 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRGP23470 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRGP23470 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRGP23470 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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