Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM35Q9UPQ4 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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