Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms