Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NEDD8Q15843 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NEDD8Q15843 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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