Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CNN3Q15417 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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