Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NKX1-1Q15270 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
NKX1-1Q15270 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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