Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GPNMBQ14956 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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GPNMBQ14956 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GPNMBQ14956 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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