Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SCARF1Q14162 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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