Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CBFBQ13951 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms