Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
RPA4Q13156 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RPA4Q13156 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms