Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RESTQ13127 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RESTQ13127 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RESTQ13127 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms