Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TNXAQ16473 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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