Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
E2F4Q16254 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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