Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ALX1Q15699 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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ALX1Q15699 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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