Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SKIV2LQ15477 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SKIV2LQ15477 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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