Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RAB39AQ14964 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RAB39AQ14964 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms