Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SQLEQ14534 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms